O Sinsaúde é constituído pelos seguintes departamentos: Presidência, Vice Presidência, Secretaria Geral, Tesouraria, Departamento de Assuntos Culturais, Departamento de Comunicação, Departamento de Esportes e Lazer, Departamento Jurídico, Departamento de Orientação Sindical, Departamento de Patrimônio e Departamento Social.